De barokke Sint Jakobus en Fillupus kerk (šv. Jokūbo ir Pilypo bažnyčia) is gelegen naast het Lukiškių plein op de plaats van een voormalig kerkhof. In 1624 werd er een houten kerk gebouwd, maar het huidige bouwwerk stamt uit het einde van de 17de eeuw. De kerk bevat twee symmetrische torens.

Een beeld van een hoog altaar met de wonderbare Moeder van God en het kindje Jezus (18de eeuw) siert het enkelvoudige schip van de cilindrisch gebogen kerk. In de kerk bevindt zich houten beelden uit de 18de eeuw van St. Hyacinthus en St. Dominicus. Tijdens het Sovjetoverheersing was de sloop van de kerk voorzien, maar uiteindelijk bleef hij in verloosde toestand staan. In 1992 werd de kerk teruggegeven aan de Dominicaanse gelovigen. Het beeld van de Genadige Moeder van God (de Lukiškės Moeder van God) is in de kerk teruggeplaatst. Het is beroemd sinds de 17de eeuw om zijn mirakels.

Het Dominicaanse klooster is gebouwd in de 18de eeuw, toen de geschiedenis van het kloosterziekenhuis, het oudste ziekenhuis in Litouwen, begon. De monniken onderhielden het klooster tot 1808, waarna dit het eerste seculaire ziekenhuis van de stad werd.